تغییرات ساختاری ژن مقاومت به زنگ قهوهای Lr35 در ژنوتیپ های مقاوم و حساس گندم نان (Triticum aestivum L.)
نویسندگان
چکیده مقاله:
زنگ قهوهای از بیماریهای مهم گندم است که باعث کاهش عملکرد آن میشود. تولید ارقام مقاوم یکی از راهکارهای اصلی کنترل بیماری زنگ گندم است. لازمه این عمل، شناخت ژنتیک مقاومت و ژنهای مقاومت به بیماری است. در این مطالعه با استفاده از سه جفت آغازگر اختصاصی طراحی شده براساس داده‌های موجود در مرکز ملی اطلاعات بیوتکنولوژی (NCBI)، قطعاتی بطول 351-340 جفت باز از ژن Lr35 تکثیر شد. قطعات پس از همسانه‌سازی، توالی‌یابی شدند. بلاست توالی قطعات تکثیری از ژن Lr35 در ژنوتیپ‌های مورد مطالعه، شباهت 95 درصد با توالی ژن Lr35 گندم نان از NCBI نشان داد. علاوه بر این، توالی‌های حاصل دارای شباهت 93 درصد با ژن Lr21 از کلون کاسمیدی 1–7–69 Aegilops tauschii، 87 درصد با ژن گلوتنین A با وزن مولکولی بالا از Triticum turgidum، 84 درصد با ژن پلاستیدی‌استیل کوآنزیم آ کربوکسیلاز (Acc–1) ازT. turgidum و ژنهای مقاومت به سفیدک پودری و تحمل به سرمای گندم نان بود. توالی‌های تکثیری با استفاده از سه جفت آغازگر، دارای یک چارچوب قرائت آزاد، به‌ترتیب به‌طول 162، 156 و 160 جفت‌باز بوده و پروتئین‌هایی بطول 54، 52 و 54 اسیدآمینه رمز کردند. بررسی ساختار توالی-ها نشان دهنده وجود ناحیه غنی از لوسین، از نواحی حفاظت شده در ژنهای مقاومت به بیماریها در گیاهان بود. تجزیه خوشه‌ای براساس توالی قطعات تکثیری از ژن Lr35 با استفاده از جفت آغازگر دوم ژنوتیپ‌ها را براساس پاسخ به زنگ آن‌ها گروه بندی کرد. نسبت جایگزینی های نامشابه به مشابه نشان دهنده نقش احتمالی گزینش مثبت و یا گرینش ایجاد کننده تنوع در تغییرات نوکلئوتیدی این ژن بود. با توجه به وجود تفاوت‌های نوکلئوتیدی بین ژنوتیپ‌های مقاوم، نیمه مقاوم و حساس، می‌توان از آن ها برای طراحی آغازگرهای اختصاصی مبتنی بر SNPها جهت شناسایی ارقام حساس و مقاومت به زنگ قهوهای در گندم استفاده کرد.
منابع مشابه
تغییرات ساختاری ژن مقاومت به زنگ قهوه ای lr۳۵ در ژنوتیپ های مقاوم و حساس گندم نان (triticum aestivum l.)
زنگ قهوه ای از بیماری های مهم گندم است که باعث کاهش عملکرد آن می شود. تولید ارقام مقاوم یکی از راهکارهای اصلی کنترل بیماری زنگ گندم است. لازمه این عمل، شناخت ژنتیک مقاومت و ژن های مقاومت به بیماری است. در این مطالعه با استفاده از سه جفت آغازگر اختصاصی طراحی شده براساس داده های موجود در مرکز ملی اطلاعات بیوتکنولوژی (ncbi)، قطعاتی بطول 351-340 جفت باز از ژن lr35 تکثیر شد. قطعات پس از همسانه سازی،...
متن کاملتغییرات ساختاری ژن های مقاومت به زنگ قهوه ای (leaf rust) در ارقام مقاوم و حساس گندم نان
چکیده ندارد.
15 صفحه اولشناسایی ژنوتیپ‌های متحمل به تنش خشکی در ژنوتیپ های گندم نان (.Triticum aestivum L)
به‌منظور شناسایی ژنوتیپ‌های گندم متحمل به تنش خشکی در گلخانه و مزرعه، 30 ژنوتیپ به‌عنوان فاکتور فرعی به‌صورت کرت‌های خردشده در قالب طرح کاملاً تصادفی و بلوک‌های کامل تصادفی با سه تکرار در شرایط بدون تنش (آبیاری به‌صورت متداول تا آخر فرایند رشد گیاه صورت گرفت) و تنش خشکی مرحله گلدهی (آبیاری تا مرحله گلدهی به‌صورت متداول و طبیعی انجام گرفت و تنش خشکی بعدازآن مرحله اعمال گردید) در سال 96-1395 در گل...
متن کاملتنوع نوکلئوتیدی نواحی ژنومی ژن های مقاومت به زنگ قهوه ای Lr29 و Lr47 در لاین های گندم نان (Triticum aestivum L.)
متن کامل
بررسی واکنش ژنوتیپ های گندم نان (Triticum aestivum L.) به تنش شوری
بررسی واکنش ژنوتیپ های گندم نان (Triticum aestivum L.) به تنش شوری مسعود گماریان1*، محمد علی ملبوبی2، فرخ درویش3، سید ابوالقاسم محمدی4، خدیجه رضوی2 1- عضو هیات علمی دانشگاه آزاد اسلامی واحد اراک 2- عضو هیات علمی پژوهشگاه ملی مهندسی ژنتیک و زیست فناوری 3- استاد گروه زراعت واصلاح نباتات، دانشگاه آزاد اسلامی واحد علوم و تحقیقات تهران 4- دانشیار دانشکده کشاورزی دانشگاه تبریز تاریخ...
متن کاملشناسایی نشانگرهای مولکولی پیوسته با ژن Lr34/Yr18و ارزیابی مقاومت به زنگ قهوهای و زنگ زرد در ارقام و لاین‌های امید بخش گندم نان (Triticum aestivum L.)
زنگ قهوهای (Puccinia triticina) و زنگ زرد (Puccinia striiformis) از مهمترین و رایجترین بیماریهای گندم در اغلب کشورهای جهان محسوب شده و نقش چشمگیری در کاهش محصول گندم دارند. انتقال ژنهای مقاومت به ارقام گندم یکی از مؤثرترین و اقتصادی‌ترین روش‌های مبارزه با این بیماریها است. یکی از ژنهایی که باعث القای مقاومت و پایداری مقاومت گیاه نسبت به زنگ قهوهای و زرد گندم میشود، ژن Lr34/Yr18 است. د...
متن کاملمنابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده{@ msg_add @}
عنوان ژورنال
دوره 12 شماره 4
صفحات 499- 509
تاریخ انتشار 2011-01
با دنبال کردن یک ژورنال هنگامی که شماره جدید این ژورنال منتشر می شود به شما از طریق ایمیل اطلاع داده می شود.
کلمات کلیدی برای این مقاله ارائه نشده است
میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com
copyright © 2015-2023